Différences
Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.
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bioinformatique [Le 17/02/2012, 10:50] YoBoY tags supperflus |
bioinformatique [Le 31/08/2022, 23:34] (Version actuelle) moths-art Passage de http à https sur les liens externes (détecté et corrigé via le bot wiki-corrector (https://forum.ubuntu-fr.org/viewtopic.php?id=2067892) |
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| ===== Bioinformatique générale ===== | ===== Bioinformatique générale ===== | ||
| - | Les modules [[http://biopython.org/wiki/Main_Page|Biopython]] et [[http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page|Bioperl]] regroupent un ensemble de bibliothèques pour les langages python et perl. Ces modules proposent des outils variés tels que l'interaction avec des bases de données biologiques publiques, la manipulation, l'annotation de séquences… | + | Les modules [[https://biopython.org/wiki/Main_Page|Biopython]] et [[http://www.bioperl.org/wiki/Main_Page|Bioperl]] regroupent un ensemble de bibliothèques pour les langages python et perl. Ces modules proposent des outils variés tels que l'interaction avec des bases de données biologiques publiques, la manipulation, l'annotation de séquences… |
| ===== Biologie moléculaire / Génétique ===== | ===== Biologie moléculaire / Génétique ===== | ||
| ==== Manipulation de séquences biologiques ==== | ==== Manipulation de séquences biologiques ==== | ||
| === Alignements de séqences === | === Alignements de séqences === | ||
| - | Le paquet [[apt://blast2]] permet d'installer en local la célèbre suite d'outils développée par le [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/|NCBI]]. | + | Le paquet [[apt://blast2]] permet d'installer en local la célèbre suite d'outils développée par le [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/|NCBI]]. |
| === design d'oligonucléotides === | === design d'oligonucléotides === | ||
| Le logiciel **primer3** ([[apt://primer3]], [[http://frodo.wi.mit.edu/primer3/]]) permet le design d'oligonucléotides en prenant en compte de multiples critères (%GC, autocomplémentarité, taille de fragment…). | Le logiciel **primer3** ([[apt://primer3]], [[http://frodo.wi.mit.edu/primer3/]]) permet le design d'oligonucléotides en prenant en compte de multiples critères (%GC, autocomplémentarité, taille de fragment…). | ||
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| =====Voir aussi===== | =====Voir aussi===== | ||
| - | * [[http://openwetware.org/wiki/Main_Page|Openwetware]] wiki biology & biological engineering | + | * [[https://openwetware.org/wiki/Main_Page|Openwetware]] wiki biology & biological engineering |
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| //Contributeur : nesthib// | //Contributeur : nesthib// | ||